課程名稱 |
生物晶片操作與資料分析 Microarray Experiment and Data Analysis |
開課學期 |
104-2 |
授課對象 |
生命科學院 基因體與系統生物學學位學程 |
授課教師 |
蔡孟勳 |
課號 |
Biot5006 |
課程識別碼 |
642EU0080 |
班次 |
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學分 |
3 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期四6,7,8(13:20~16:20) |
上課地點 |
生技所415 |
備註 |
本課程以英語授課。 限學士班三年級以上 總人數上限:10人 外系人數限制:9人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1042Biot5006_ |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
1.基本分子生物實驗的操作,包含細菌培養,DNA分離,電泳分析以及PCR.
2.基因晶片備製過程學習
3.細胞培養及RNA的提取
4.基因晶片的螢光標記和雜交反應
5.基因晶片的螢光掃描以及影像分析
6.建立基因晶片數據資料庫
7.利用高階軟體進行基因晶片結果之分析判讀以及推論實驗結果在生物上的意義 |
課程目標 |
使學生對於基因晶片的備製,應用及結果之分析有實際操作和深切的認識,進而啟發學生在此一新興跨領域的學習與研究。 |
課程要求 |
一、成績評量方式:
1.出席及課堂表現 10%
2.實驗報告 50 %
3.期末考 40%
二、預修課程:
生物晶片技術概論 |
預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
待補 |
參考書目 |
教科書: DNA Microarrays :A Molecular Cloning Manual
David Bowtell and Joseph Sambrook
Cold Spring Harbor Laboratory Press |
評量方式 (僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
2/25 |
Overview |
第2週 |
3/3 |
Inoculate, DNA miniprep |
第3週 |
3/10 |
Generation of Targets for Spotted Microarrays (PCR and spectrophotometer) |
第4週 |
3/17 |
Printing Spotted Glass Microarrays (Printing design (OmniGrid arrayer))
地點:臺大醫院基因體中心會議室
時間:2點集合 |
第5週 |
3/24 |
Generation of Targets for Spotted Microarrays (Plate transfer, Beckman FX)
地點:長興街生技館415
時間:2點集合 |
第6週 |
3/31 |
No class today (Spring break) |
第7週 |
4/7 |
microarray slide post-processing |
第8週 |
4/14 |
mid-term |
第9週 |
4/21 |
AACR_no class |
第10週 |
4/28 |
cell culture and RNA extraction |
第11週 |
5/5 |
RNA purification |
第12週 |
5/12 |
probe labelling and microarray hybridization |
第13週 |
5/19 |
gal file introduction and image analysis |
第14週 |
5/26 |
data analysis |
第15週 |
6/2 |
real-time RT PCR introduction
(13:30準時上課) |
第16週 |
6/9 |
端午節 |
第17週 |
6/16 |
illumina and affymetrix introduction |
第18週 |
6/23 |
final exam (明達203, 13:20開始考試) |
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